Hoewel de Menabo Mistral veel goede eigenschappen heeft, zijn er ook duidelijke beperkingen en aandachtspunten. Het belangrijkste nadeel is de maximale draagkracht van 45 kg: dat betekent dat zwaardere elektrische fietsen, volle e-mountainbikes of twee e-bikes niet mogelijk zijn. In de huidige markt waar e-bikes steeds populairder worden, is dit een serieuze beperking voor gebruikers die elektrisch ondersteunde fietsen willen vervoeren.
Daarnaast kan de montage op de achterklep, afhankelijk van de vorm van de auto en belading, leiden tot minder zicht op achterlichten of het kenteken. De Mistral zelf bevat geen geïntegreerde verlichting of kentekenverlenging, dus in sommige gevallen moet je extra verlichting of een kentekenplaatdrager aanschaffen om wettelijk en veilig te blijven rijden. Er is ook geen ingebouwd slot voor anti-diefstal; fietsen moeten dus apart worden vastgezet.
Verder vereist correcte montage enige aandacht en ervaring: onjuiste bevestiging kan leiden tot speling en meer beweging tijdens het rijden, wat trillingen en geluid kan veroorzaken. Hoewel de rubbers schade beperken, zijn krassen bij ruwe handling of verkeerd afstellen niet helemaal uit te sluiten. Tot slot is de stalen constructie zwaarder dan aluminium alternatieven en kan bij langdurig intensief gebruik de corrosiebestendigheid een aandachtspunt zijn zonder regelmatig onderhoud.